Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms