Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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LRRC3Q9BY71 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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LRRC3Q9BY71 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC3Q9BY71 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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