Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAPERQ9BY12 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms