Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SALL3Q9BXA9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms