Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms