Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms