Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms