Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM29Q9BSF4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms