Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms