Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms