Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP8Q99708 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP8Q99708 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms