Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POP1Q99575 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP1Q99575 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP1Q99575 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP1Q99575 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP1Q99575 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP1Q99575 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms