Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP19Q99542 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms