Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms