Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms