Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms