Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms