Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms