Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms