Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms