Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC11Q96J66 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC11Q96J66 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCC11Q96J66 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ABCC11Q96J66 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ABCC11Q96J66 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC11Q96J66 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms