Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms