Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms