Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC102AQ96A19 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms