Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3Q969T4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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