Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP13Q92995 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP13Q92995 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP13Q92995 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP13Q92995 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP13Q92995 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP13Q92995 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP13Q92995 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP13Q92995 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP13Q92995 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms