Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO1Q92973 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms