Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms