Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF31Q8WWY3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms