Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM41Q8WV44 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms