Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms