Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX29Q8TEQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX29Q8TEQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms