Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELQQ8TDG4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms