Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC103Q8IW40 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC103Q8IW40 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms