Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms