Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
STRCQ7RTU9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms