Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms