Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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