Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms