Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT3Q6L9W6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT3Q6L9W6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms