Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF123Q5XPI4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms