Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUSD4Q5VX71 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms