Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms