Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRNL1Q5VV63 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms