Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms