Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A3Q5K4L6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms