Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms