Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC178Q5BJE1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms