Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms