Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A12Q504Y0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms